O sistema nervoso das aranhas, ao contrário dos outros aracnídeos, está completamente concentrado no cefalotórax. As massas do tecido nervoso (gânglios) são fundidas com um gânglio encontrado sob o esôfago e abaixo e atrás do cérebro. A forma do cérebro, ou gânglio epifaríngeo, reflete um pouco os hábitos da aranha; ou seja, nos construtores de teias, que são sensíveis ao toque, a parte posterior do cérebro é maior do que nas aranhas que caçam com a visão (Salticidae).
O sistema respiratório, localizado no abdome, consiste em preservar os pulmões e traqueias . Nas aranhas, os pulmões foliáceos são órgãos respiratórios pareados compostos de 10 a 80 folhas ocas que se estendem para um seio sanguíneo separado por pequenas colunas endurecidas. Os pulmões abrem-se em câmaras (átrios), que se abrem para o exterior através de uma ou várias fendas (espiráculos). As traqueias são tubos que conduzem o ar diretamente para vários tecidos. Os dois órgãos respiratórios na extremidade frontal do abdome geralmente são pulmões foliáceos, e os dois traseiros são traqueias. No entanto, em alguns grupos, ambos os pares são pulmões foliáceos (como nas tarântulas). É impossível determinar, a partir da estrutura da superfície, se uma aranha tem pulmões foliáceos , traqueia ou ambos, porque os órgãos respiratórios são cobertos no exterior por placas endurecidas.
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